Năm 2021, ngành Toán ứng dụng bậc cử nhân của Khoa đã được chứng nhận đạt chuẩn AUN-QA. Ngành Toán ứng dụng bậc thạc sĩ và ngành cử nhân Thống kê của Khoa Toán - Thống kê cũng đã hoàn tất kiểm định vào tháng 12/2024 và đã đạt chuẩn. Thông qua hoạt động kiểm định AUN-QA, những điểm mạnh và điểm tồn tại của chương trình đào tạo của hai ngành sẽ được thể hiện rõ, và Nhà trường cũng như Khoa sẽ có kế hoạch, hành động cụ thể để khắc phục những tồn tại và cải tiến chương trình đào tạo, cải thiện, nâng cấp và đảm bảo chất lượng của môi trường dạy và học.